Pese a que los ajolotes están sujetos a protección especial por la Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales (Semarnat) su población sigue reduciéndose.
De acuerdo con la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO), el ajolote de Xochimilco es tan sólo una de las nueve variedades de ajolotes endémicos catalogados en Peligro Critico de Extinción por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN) .
Los ajolotes que se encuentran en peligro crítico son:
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